聂卫平的颠峰岁月是在八十年代在举国瞩目的中日围棋擂台赛。他连任数届中国队主将，为中国队的连胜立下奇功。
1985年在第一届中日围棋擂台赛中，日本超一流棋手小林光一九段连克中方六将，中方曾以5比7落后于日本队，聂卫平作为主将出战，应战小林光一九段，8月27日和29日在日本连续战胜超一流的九段棋手、十段战冠军小林光一和王座战冠军加藤正夫，把比分扳成7比7平，11月在北京又击败日本擂主、曾六次夺得“棋圣”战冠军、被授予“终身棋圣”称号的藤泽秀行，为中国赢得了擂台赛的胜利，实现了中国棋手首次战胜日本“超一流”棋手的重大突破。
1986年在第二届中日围棋擂台赛中，他连克日方五将，再次使中国队反败为胜。
1987年在第三届中日围棋擂台赛中，迎战日本队主将加藤正夫，中盘取胜，中国队“三连胜”。聂卫平的个人声望达到顶点。
聂卫平在中日围棋擂台(4张)聂卫平比赛期间，上至国家领导人，下至平民百姓，均无不关心其比赛情况；清华大学、北京大学等学生也因其捷报而游行庆祝。聂卫平成为那个时代中国的“英雄人物”。在中国掀起了学围棋的热潮，这其中就包括了后来成长为一流棋手的常昊、周鹤洋、罗洗河。
聂卫平1986年起任国家围棋队总教练。1988年在首届“富士通杯”世界职业围棋锦标赛中，获第三名。1989年在首届“应氏杯”世界职业围棋锦标赛上，获第二名。1988年3月22日为表彰聂卫平对围棋事业的杰出贡献，国家体委和中国围棋协会授予他“棋圣”称号。九十年代后，在我国新举办的“国手战”、“名人战”、“棋圣战”中，均获首届冠军。
